Agrupamientos en redes familiares con NodeXL

Agrupamiento de NodeXL para los partidos de los parientes de mi mamá

Genes and Roots

Publiqué los resultados del agrupamiento de NodeXL de mi padre hace unas semanas (aquí). Como lo prometí, ahora estoy publicando los resultados del agrupamiento NodeXL de mi madre, centrándome en solo algunos de los aspectos más intrigantes (¿desconcertantes?). (Puedes leer un paso a paso sobre cómo usar NodeXL para agrupar tus coincidencias de Ancestry aquí, en el blog de Shelley Crawford).

Las coincidencias de mamá para este ejercicio de agrupación se limitaron a aquellas con 15 cM o más compartidas; simplemente se desordena si incluyo a todos hasta 6 cM.

También en la foto de abajo, he apagado la pantalla para todos los grupos con menos de 4 personas. (Los algoritmos de NodeXL se agruparán en grupos de dos, mientras que otros algoritmos como la herramienta de agrupación compartida de Jonathan Brecher usan tres como mínimo).



Veamos primero el "Grupo 13", el grupo en la parte inferior en azul marino que se ve como 2 grupos separados para mí. (No entiendo completamente cómo funciona el algoritmo). A continuación se muestra el grupo 13, ampliado y con los enlaces intergrupos desactivados, para que pueda ver el grupo de manera más detallada. Claramente, solo una coincidencia enlaza a las dos mitades de este grupo. Por lo tanto, no están relacionados tan estrechamente como uno podría pensar.



Las fotos adicionales a continuación confirman esa teoría. A la izquierda, "Cousin X" está resaltado; Puedes ver que "X" comparte una coincidencia con solo 2 personas (además de mi madre). A la derecha, se resalta "Primo B". "Primo B" solo coincide con otros en un subgrupo, y nadie en el otro subgrupo.



Otro grupo que se ve intrigante es uno de la prima de mi madre, "Sally Sue" (alias), que está bastante relacionada con mamá. (Se puede decir que está más estrechamente relacionada con mi madre por el tamaño del cuadrado azul. Estos partidos se parecen a un centro y radios. "Sally Sue" está en el centro con el cuadrado más grande; los otros están más relacionados con mi madre. (Aparte de eso, la opción de ajustar el tamaño de los cuadrados o puntos por la cantidad de cM compartida está disponible en la herramienta NodeXL, pero no es automática).

El grupo "Sally Sue", que se muestra a continuación con los enlaces externos eliminados, es uno en el que coincide con todas las personas de su grupo, pero cada una de ellas solo coincide con ella (o, no se muestra, al menos una persona en un grupo diferente).



El último grupo que es interesante se muestra a continuación. Esta prima, llamémosla Jane, parece estar en el grupo "incorrecto". Si bien tiene coincidencias en su propio grupo, tiene muchas más coincidencias en un grupo diferente.



Una razón por la que esto podría suceder es que Jane y mamá podrían compartir el ADN en, por ejemplo, el cromosoma 1 (posiblemente con otros en su grupo); los primos en el otro grupo podrían compartir el ADN con mamá en, digamos, el cromosoma 9, y luego compartir el ADN con Jane en el cromosoma 4. No lo sabemos con seguridad, ya que no tenemos información de segmento.

Sin embargo, desde que agrupé las coincidencias de mi madre en NodeXL y comencé el borrador de esta publicación, usé la herramienta de agrupación compartida de Jonathan Brecher, que agrupa a "Jane" con la agrupación donde tiene la mayoría de sus coincidencias.

A primera vista, eso tiene más sentido. Sin embargo, ver a "Jane" en un grupo separado (como se muestra a continuación) podría ser útil para darse cuenta de que puede estar conectada en un ancestral diferente a mi madre que la mayor parte de sus coincidencias. Esto sugiere que debo tener cuidado al analizar el árbol de Jane y los apellidos ancestrales, en relación con las coincidencias en el otro grupo.

De hecho, estoy descubriendo que es útil agrupar tus coincidencias de ADN compartidas con más de una herramienta, ya que cada una usa diferentes algoritmos. (Más sobre otros métodos de agrupación en una publicación posterior).