Redes de correlación en Biología

Super interesante uso de las redes para interpretación de correlaciones...
Análisis y visualización de datos biológicos de alta dimensión
Creative Data Solutions


Los datos biológicos de alta dimensión comparten muchas cualidades con otras formas de datos. Normalmente es amplia (variables << variables), complicada por el diseño experiencial y compuesta de relaciones complejas impulsadas por fuentes biológicas y analíticas de varianza. Por suerte, la potente combinación de R, Cytoscape (<v3) y el paquete R RCytoscape puede usarse para generar representaciones altamente dimensionales y altamente informativas de datos biológicos complejos (y realmente cualquier tipo de ellos). Se puede comprobst los siguientes ejemplos de mapeo de red en acción o vea una presentación más detallada de las técnicas utilizadas a continuación.


Red de correlación parcial que resalta los cambios en el tumor en comparación con el tejido de control del mismo paciente.

Red de tejidos de cáncer


Red de similitud bioquímica y estructural de los cambios en el tumor en comparación con el tejido de control del mismo paciente.

Red de tejido de cáncer


Clústeres jerárquicos (color) mapeados a una red de similitud bioquímica y estructural que muestra la diferencia antes y después de la administración del fármaco.

 Red de jarabe para la tos


Red de correlación parcial que muestra cambios en las relaciones de los metabolitos en respuesta al tratamiento farmacológico.

Red de respuesta al tratamiento



Red de correlación parcial que muestra los cambios en la enfermedad y la respuesta al tratamiento farmacológico.